Мне кажется, что все у Вас нормально. И корни засыпать не надо.
Когда-то одна мудрая женщина, у которой я учился уходу за орхидеями, объяснила мне как контролировать годность субстрата. Месяца через 1,5-2 после посадки надо аккуратненько вытащить растение из горшка и посмотреть на его корни.
Если они растут вниз, к дну горшка, то все нормально.
А вот если новые корни не идут вниз, а растут горизонтально, по направлению к стенкам горшка и потом вылезают наружу, это говорит о том, что субстрат слишком плотный и корням не хватает воздуха.
В этом случае субстрат в нижней части убирают и заменяют более рыхлым, с большим количеством кусочков коры.