Болеет Юкка, помогите советом!

[Мисс Виолет]

Первый раз просто перевалила Юкку в достаточно большой горшок

Помимо того, что горшок был огромный, в результате перевалки в горшке оказались два разнородных грунта, отличающихся по влагоёмкости. В то время, как один из них был уже сухой, другой оставался ещё мокрым.

я имела ввиду стоит ли его спасать или тоже обрезать ?

Как его спасать я написала выше - отрезать побег, удалить все жёлтые ткани и укоренить зелёную макушку.
Оставшийся пенёк надо посадить по правилам. Теоретически на нём могут проснуться спящие почки, из которых вырастут новые побеги.

Полностью срезать только побеги ? На пеньке не стоит делать никаких надрезов ?

На пеньке никаких надрезов не делать. Только удалить пожелтевшие остатки побегов, т.к. из этих остатков уже ничего не вырастет, но инфекция может распространиться на пенёк.

Как выглядит эта корневая шейка ? )

Корневая шейка - это место на стволе, откуда начинают расти корни. Она должна находиться на уровне грунта. Закапывать ствол в грунт нельзя, это приведёт к загниванию.