Промывать корни из-за единственной многоножки совершенно не следовало. Большинство растений болезненно относятся к этой процедуре, тем более, каламондин плохо перенес промывание грунта.
Небольшой хлороз есть, но сейчас подкармливать нельзя. Растения не подкармливают в течение как минимум 1-1,5 месяцев после пересадки.
Также Вашему каламондину не хватает света.
И при пересадке Вы заглубили корневую шейку, что делать недопустимо.